此时长安方面并不安宁，唐昭宗削藩蜀中失败，讨伐李克用也失败，雄心壮志在现实面前只得低头，当然这并非他之过，历史对昭宗的评价不过是为父亲和兄长埋单，晚唐就是在他们的折腾下才变得千疮百孔。昭宗即位之初曾是一位雄心勃勃的青年，不过此时已经无力回天，各藩镇已经变成尾大不掉，无奈只得日夜借酒消愁。
凤翔节度使李茂贞离长安最近，眼看皇帝逐渐消沉，觉得自己主宰大唐的机会终于到来，到处用兵扩大地盘，朝中大臣斥责他轻慢朝廷。李茂贞也不示弱，直接写信侮辱皇帝：“没本事就不要干那些事，早知如此何必当初？”唐昭宗阅罢大怒，再怎么软弱我也是大唐皇帝，还轮不到你指手画脚，于是派宰相杜让能率禁卫军攻打李茂贞，李茂贞深知禁卫军不过是花拳绣腿，激怒他的目的就在于此，立即率军反击并将杜让能打败，杜让能只得逃回长安。
李茂贞率大军直抵长安城下，声称杜让能嫉贤妒能，鼓动陛下无端猜忌大臣，要求将其斩杀，其实就是威胁皇帝，你不杀他我就杀进长安城。唐昭宗当然知道来者不善，无奈在宫中来回徘徊，彻夜不眠，杜让能无愧于乱世忠臣，得知实情后挺身而出：“陛下，眼下只有牺牲我才能保住长安，我愿意领死保全朝廷。”唐昭宗含泪与之告别，并赐予一杯毒酒，李茂贞这才罢兵，从此大唐皇帝的威信扫地，李茂贞等军阀愈发嚣张。
与此同时河中也发生内乱，早年节度使王重荣被部将所杀，拥立弟弟王重盈接任，没几年王重盈病逝，正当众将为继位人选犯难之时，李克用凭借手中武力向朝廷奏请王珂复位，因为王珂既是王重荣的养子，也是李克用的女婿，唐昭宗不敢得罪李克用，当即应允下诏。可是王重盈两个儿子王珙和王摇不服，准备发兵攻打王珂，不过二人知道自己不是沙陀兵的对手，于是写信向朱温求援。
朱温的手段实在太高明，不仅希望河中闹越乱越好，还要借助其他力量牵制李克用，王珂其实也是王重盈的儿子，不过从小过继给伯父王重荣，朱温决定借此做文章挑起内部矛盾，于是回信王珙兄弟，说自己正忙处理朱瑄和朱瑾的事，一时半会腾不出手，王珂早年过继给伯父，没有资格即位，你们可以写信给李茂贞、王行瑜、韩建等三位节度使，二人一定为你们主持公道。
王珙兄弟按照朱温的建议写信给这三位节度使，这三人当然不愿看到李克用的势力增强，立即向唐昭宗陈述他们的意见，要求由王珙、王摇其中一人接任，唐昭宗前面已经答应李克用，当然不能随意更改，只好婉言拒绝。三人于是带兵前去长安讨说法，逼迫唐昭宗杀掉宰相韦昭度及宦官十几人，声称昭宗所谓均为韦昭度等人怂恿，实际就是逼宫，可怜的唐昭宗无奈，只得重新下诏书让王珙接替河中节度使。