为了打败武斗道馆的格斗馆主藤树，继续旅行的小智一行人把锻炼自己和寻找稀有的宝可梦当做了目标，沿着一条无名河逆流而上，来到一个瀑布，一番折腾爬了上去到了一片沼泽。大伙很快就和“沼鱼宝可梦”水跃鱼以及沼泽的主人沼田认识，他们得知这里是专门培育水跃鱼宝宝的地方，孵化后的小水跃鱼将会被运送到培育的地方，专门培育后再送给宝可梦训练家初学者（无数御三家的来源之一），在他的小屋里，沼田告诉小智等人他的工作，并带他们参观了小水跃鱼的孵化；但聊到之前那只努力守护这片沼泽的水跃鱼却发现他是野生的，沼田已经不记得它是什么时候来到这里的，因为已经长大了无法再去专门培育的地方，但这只水跃鱼把自己当成了这里的一份子，它在最开始很防备小智一行人接近这里的水跃鱼，不过在明龖的“威逼利诱”下它似乎有所改观。正当大家对这些事情倍感兴趣时，打算夺走水跃鱼的火箭队出现了，沼田是位和善的老人，虽然他忠于职守，但他改不掉的多嘴性格常常会导致一些不必要的麻烦；这不火箭队得到“提示”破坏了管理水量的堤坝导致许多小水跃鱼被大量的水冲走，小智一行人找回所有水跃鱼们并打跑了火箭队；看到水跃鱼和明龖的关系变得“亲密”之后（主要还是它头上的鳍是十分敏感的雷达，可以不靠眼睛从空气或水的流动中捕捉周围的状况，明龖给到压迫有点大，时刻都会盯着他），沼泽的主人就拜托明龖带走这只水跃鱼，这也是在给它机会。明龖瞬间醒悟，小刚应该是没有机会了，水跃鱼要跟自己；拒绝肯定是不可能拒绝的，加上莲叶童子，自己就可以凑齐6只水系宝可梦了（有人有话要说的），反正水系这条路是一定会走到最后的。
自我安慰做的不错，但最真实的是明龖应该就要承担至少在丰缘地区小刚的“职责”，明龖和小刚还是差了不少的，不晓得会造成怎样的影响；但明龖也没有办法，那么莲叶童子应该也是要跟小刚的，命运的车轮滚滚向前，只能骑驴看唱本—走着瞧了。
巨沼怪，丰缘地区的御三家，水+地面属性，可以进入了超级进化形态，得以成为了雨天队的常见打手；只有一个弱点，就是有点致命的4倍弱草，还好草系不算强势，另外巨沼怪的速度偏慢也容易陷入一个很尴尬的境地，巨沼怪在很多情况下，都处于一个被动的状态（拿不到先手）。超级进化就是对它龟速的补偿，超级巨沼怪的特性是悠游自如，雨天队里就会是很好的物攻手；但如果没有超级进化和雨天，那就有点普通了，双防倒是可以，但一般都是肉盾。成都地区恶系天王梨花姐姐的经典台词：“强大的精灵，弱小的精灵，那只是人们的一己之见；真正强大的训练师，应该为了使自己喜欢的宝可梦胜利而努力”。明龖既然选择了水系这条路，那就努力做好它，冠军什么的还真没什么欲望，能有的野望也就是“回去”看看了。
关于这个野望，也就雪拉比比较有可能，但宝可梦世界有可能回到现实世界吗?好像维度都不太一样，没有雪拉比的世界它能不能到达也是一个不小的问题；还是说考虑基拉祈的伟力，可十有八九它不会看上明龖的，很多细节一旦去深究就会“万念俱灰”。
不管怎么说，水跃鱼是收定了，水系也是没跑了，但有机会还是会继续尝试的；就是要拿小刚的剧本有点抵触，不过明龖就是明龖，对于美好的事物肯定会有所追求，但自己该是什么样就是什么样，命运的车轮不能左右明龖的个人好恶，更何况还有大姐大在。
来到某个洞窟做修行的小智一行人，一不小心激怒了在洞窟睡觉的大声宝可梦吼爆弹（请大家好好记住它，著名的马甲龙套，转动头部的圆形喇叭，以大音量的超音波重击敌人，会用脚用力重踩来累积威力，它巨大的声音产生的冲击波能够把卡车推翻），在急于逃离吼爆弹追打的情况下，小智它们居然与皮卡丘他们走失了，身边只有傲骨燕和大姐大，莲叶童子和水跃鱼都和它们一起。而此时，勉强逃到外面的皮卡丘等宝可梦也拼命的想要寻找小智他们，宝可梦们还好都没有受伤，便是以出去远足的心情往森林前进；但是，四周突然响起奇特的草笛声，皮卡丘他们像中了催眠术一样，开始在同样的地方打转起来。原来是住在茂密森林里的长鼻叶，它用自己头上的叶子做的草笛吹奏的音色会让人变得意识模糊；机警的木守宫最快醒悟过来，叫醒了大伙，气不过的龙虾小兵还教训了这只长鼻叶。就是喜欢恶作剧的长鼻叶马上呼唤同伴，准备好好的找回场子；主场作战的长鼻叶肯定优势明显，还好乱入的火箭队打破这个局面，三人组这次抓了所有的长鼻叶和皮卡丘。小智再次关键时刻出手，解救了长鼻叶们，还体验了一次“高空速降”，木守宫和龙虾小兵配合赶跑火箭队，它们的天赋真心不错；亲和力一定爆表的皮卡丘还有大家和长鼻叶建立“革命友情”，但大家都是一碗水端的相当平，那就不好意思也就交交朋友了。
橡实果稍稍成长就可以进化为长鼻叶，后者使用叶之石进化为狡猾天狗；这种有三个形态两次进化的宝可梦一般都是不弱的，橡实果使用叶子每天清洁一次自己的身体，看起来很像一枚橡子，因为它看起来太像橡实了，所以经常吓到在森林里找食物的精灵；橡实果从树上吸收水和养分，它喝的水越多，它的身体就会越有光彩，它吃完东西后身体会变得很沉，有时就会扑通一声掉到地上开始宝可梦的生活。狡猾天狗就神秘多了，据说居住在远离文明的森林深处，尤其是在很大很古老的树林里；狡猾天狗实际上总是带领着一大群橡实果和长鼻叶甚至还有级别较低的狡猾天狗，而且它们对自己的族群很忠诚，人人往往畏惧狡猾天狗并将它们视作森林的守卫者，如果狡猾天狗离开它们的栖息地，它们落脚的地方总会伴随着寒冷的狂风。
远离人类的宝可梦都有不少的神秘色彩，当然主要还是神兽，它们的传奇很多是造物主赋予的，但同样也肩负了很多平衡的责任；普通的宝可梦最终成长到了顶级阶段，超强的能力和神出鬼没的行踪也会给它们带来不小的“滤镜”，但同样是责任重大。
以打败武斗道馆的道馆馆主藤树为目标，还在持续修行的小智等人，很快又和小田卷博士再次相遇，博士刚刚也挑战了一下吼爆弹，大伙就愉快地决定今天跟着小田卷博士去好好探索探索。在某个洞窟里面发现了少年和辉的秘密基地，没经主人同意就闯了进去，和辉让土居忍士用乱抓赶走了进入秘密基地的小智一行人。之后，他又遭遇了火箭队，火箭队却将和辉的秘密基地据为己有，并捉走了和辉的土居忍士；接着突然出现神秘的一伙人——熔岩队打败了火箭队，占据了这个基地，熔岩队在秘密基地内开始挖洞，挖到很深的地方时，火箭队看熔岩队的情况，认定此地必有宝物，遂在后头紧跟上来。当和辉坐在海边独自郁闷时，他再次遇到小智等人，他告诉小智等人他虽然喜欢宝可梦，但他从未在宝可梦比赛中获胜过，因此他讨厌比赛只想独自躲起来，小智提议由自己来当和辉的特训对手，并决定帮助和辉找回他的土居忍士。
在和辉再次来到秘密基地时，他惊讶地发现自己的秘密基地被破坏了；他和小智等人从墙后的大洞来到一处遗迹，目睹了熔岩队和海洋队的会面。在熔岩队和海洋队离开后，和辉在小智的帮助下从火箭队手中救出了土居忍士，并让土居忍士使出秘密之力打飞了火箭队；最后，和辉同小智约定等他变强之后再进行一场对战，小智就是擅长处理这种问题。
对于今天熔岩队和海洋队的两个干部火焰以及泉，明龖还真的挺熟悉的，两个都是各自团伙的中层干部，这次他们也是在寻找觉醒祠堂，发现只是普通的遗迹也就快速离开；他们的直接社会危害其实还好，就是一群有着狂热追求的疯子，但不可避免的会造成社会动乱。
秘密之力就是好东西了，明龖应该要找个机会带他们去逛逛自己的“秘密基地”，不然很多东西真的很难自圆其说，不过这个机会比较难找；但这些最好都要解释一下，要是一直这样也会容易穿帮的，这点事情有必要抓紧抓紧，最近是有点松懈过度了。