为了观看千年彗星的出现（千年等一回），小智一行人前往将举办庆典的法恩斯的游乐场。当他们跑到指南上所描述的地点时，却失望地发现这里是一片荒凉的空地。由于天色已晚，他们只好在这里吃晚饭（艰苦朴素的开始），并决定在此露营过夜。夜里，当大家都在睡梦中时，一群车队从山的那头驶过来，惊醒了小智几个；他们跑到悬崖处，发现那正是载着摩天轮和其他游乐设施的流动游乐场的车队。车队在空地中央停了下来，工作人员开始架设和布置游乐场，小智他们之前的失望一扫而空，跑下斜坡兴致勃勃地看他们“组装”游乐场。
最后到达的是一辆货柜车和一辆房车，一位身着白色燕尾服的男人提着一只箱子从货柜车走下。他从手绢中变出一只手杖，敲开箱子，从中引出一个个红色的弹性大球；大球们依次蹦向对面的房车，房车后面正好走出一位手持两把红色羽扇身穿红色礼服的大姐姐，她用扇子轻拍大球，让它们撞在一起后弹开，围成一个圆，大球们站稳后立即爆炸，留下八个长方体装置，它们自动连接在一起，伸出支架，在晨曦中充起气囊，形成了一个顶端可开启的大帐篷。小智一行被这一切深深吸引了，里面的科技含量高的有点吓人，明龖也不由得叹为观止。
铺设路轨的工程车驶入游乐场，最后而至的小火车将第一拨游客带到了晨光下的游乐场。小智一行在游乐场尽情玩耍，忽然捡到三个小丑散发的传单（那里都少不了的火箭队），那是大魔术师巴特勒的魔术表演（就是之前的那对男女），于是四人决定前去观看表演。
表演在大帐篷举行，巴特勒以将青绵鸟(鸽子已经失业)从礼帽中变出作为表演的开场。随后他将礼帽放在道具桌子上，把奇鲁莉安从帽子下面变了出来；接着巴特勒将奇鲁莉安脚下的道具立起来，变成一只筒，把奇鲁莉安藏在里面，又把魔术棒变成一块大红布盖在筒上；紧接着巴特勒又变出一支一段喷火的魔术棒，一把点燃了红布，红布爆出一团粉色烟雾。待烟雾散去，巴特勒的助手，那位红衣女子黛安抱着一块深紫色的结晶从桌上站起来，还算是中规中矩的开场，各种机关的衔接浑然一体，还是要感慨科技的力量。就当她举起那块结晶的时候，坐在观众席的小胜忽然看见结晶发出耀眼的光芒，同时听到一声细微的呼唤：“正在……呼唤我……”。
巴特勒走向舞台前，向观众致意并介绍启自己的助手们，在这时小胜又听见那个声音说“听见星星的声音……”“是谁在说话？”小胜疑惑不解，随后那个声音又响起，“是我，基拉祈”，就是助手黛安手里的结晶发出的声音！小胜想一探究竟，把爆米花扔到一边，跑向舞台，小智见状，也把爆米花塞给小遥去追小胜；小胜爬上舞台，打断了巴特勒和黛安，告诉两人自己听到了声音，小智也随后赶到，边道歉边拉小胜回去。不过巴特勒决定顺着他们继续表演，让小丑推出一只箱子，请两个小朋友和皮卡丘坐进箱子，要他们想办法从箱子里逃出去。看着小智和小胜“狡猾地”跑上舞台参加表演，台下的小遥更是嫉妒不已，这种热闹小遥竟然错过了。
两人被关进箱子，两个小丑把箱子转了几圈，巴特勒请出了彷徨夜灵。在巴特勒数完十后，彷徨夜灵的破坏光线将会把箱子炸个粉碎，所以小智他们必须在这之前逃出来。倒计时开始，灯光聚集在彷徨夜灵和箱子上面，激动人心的时刻开始了，但是箱子里的小胜还在对刚才发生的怪事百思不得其解。不过就在彷徨夜灵的破坏光线发射的一瞬间，箱子下面一空（常规的魔术伎俩），小智和小胜掉到一块垫子上，随后两人被藏在舞台下的传送装置送走；箱子爆炸了，从浓烟中飞出许多花束，而在这时，小智和小胜已经被运送到观众席后面去了。
小智和小胜在观众的掌声中跑上舞台，就在这时一只机械手突然伸过来抓走了皮卡丘，那两个打工的小丑原来就是武藏和小次郎；两人脱去小丑服，表明了自己的真实身份，皮卡丘想逃脱却因为是绝缘球所以毫无效果，两人乘上飞艇准备逃走，顺手还带上了巴特勒的土狼犬和奇鲁莉安，原来在控制灯光的喵喵也打开了大帐篷顶上的开口，并跳到飞艇上。眼看三个小偷就要扬长而去，小智决定放出宝可梦把他们打下来，却被巴特勒制止。巴特勒对观众说这是最后一部分的表演，然后就让彷徨夜灵对飞艇使出鬼火，鬼火烧断了一根缆绳，喵喵三人组只好扒在另一根缆绳上，关皮卡丘的绝缘球也掉下来，被小智接住了，随后皮卡丘使出十万伏特解救了土狼犬和奇鲁莉安，两只宝可梦漂亮地落在过道上，赢得了一片掌声。最后彷徨夜灵使出黑夜魔影，让三个宝可梦小偷彻底消失在蓝天中，这次他们应该不会如此简单的善罢甘休；观众们以为这都是表演里的一部分，全部投以热烈的掌声和欢呼，巴特勒出色地完成了救场表演。
表演结束后，小智一行人被留了下来，巴特勒告诉了他们关于基拉祈的传说—据说基拉祈氏只有一千年才会醒来一次，助人达成愿望的宝可梦，现在它就沉睡在那块结晶中。至于小胜听到的声音，那是因为基拉祈只有在千年彗星出现的七天里出来活动。据说在那期间，它会选择心地纯真、能够保护自己的少年作为伙伴，也就是说小胜是被基拉祈选中的少年（无法拒绝的光环）。
千年彗星就要在今晚出现了，巴特勒将沉睡着基拉祈的结晶托付给小胜，请小胜一定要当基拉祈的伙伴，于是小胜收下了结晶。小遥对这块神秘的结晶充满好奇，想要抱一下它，但是因为之前吐槽小胜根本不是个纯真的少年而被小胜拒绝，这对姐弟总是这样。
傍晚时分，在游乐场的市场上，小遥看中了一款挂饰，店主介绍说那是千年彗星的护身符，“圆梦之星”，又叫“七夜的许愿星”；在可以看见千年彗星的七天之间，每天晚上都默念愿望，折入一个星星的角，等第七个夜晚结束的时候愿望必定会达成。小遥听到它可以达成愿望很高兴，立即买了一个，很多传说不一定要有多真实，它们的存在就是一种美好。
天黑了下来，游乐场燃放起庆祝宝可梦的烟火，小胜举起结晶，和基拉祈一起欣赏那些美丽的烟火。小智一行来到离游乐场不远处的一处草地准备观赏千年彗星，但是天上的云迟迟不肯散去，似乎今晚看不到千年彗星了，四人觉得很失望，但仍然坐在那里等待。
夜深了，游乐场的灯火黑了下来，这时天上的云也慢慢散了开来，传说中的千年彗星拖着一条长长的弯曲的尾巴赫然出现在了夜空之中。坐在岩石上的小遥赶紧取出圆梦之星许愿，并折起了第一颗星星的角。三个少年感叹着千年的漫长与瞬间，却发现小胜已抱着结晶入睡，小遥从岩石上轻轻跳下，坐在弟弟身边，抚摸他的头发；小胜在睡梦中轻轻呼唤了一声妈妈，小遥似乎想起什么，抬起头，闭上眼轻轻哼起了妈妈常唱给姐弟二人的摇篮曲。小遥哼了一段，爬上岩石继续哼唱，在小遥的歌声里，小胜怀中的结晶发出光芒，惊醒了小胜，小胜把结晶放在地上，“星星……星星在呼唤我”这次小智和小遥也都听到了这个声音，那是心电感应。
在远方一片森林深处，一只阿勃梭鲁看见这里的岩石发出了绿光，于是它出发随着绿光扩展的方向奔去。这些绿光聚集到小胜眼前的结晶，结晶的光芒愈加耀眼，它飘浮到空中，在白色的光辉中伸展出许多白色线条，同时慢慢变形，待白光褪去，结晶已经变成了基拉祈。基拉祈飘落下来，包裹身体的布幔解开，小胜上前接住基拉祈，基拉祈在小胜的怀中慢慢睁开双眼，迷惘地看着周围的一切，小胜他们看到基拉祈清醒过来，围在它身边做了一番自我介绍。
这时，黛安跑了过来，惊讶地发现基拉祈已经清醒，她让四人在自己的房车上等待，自己前去通知巴特勒。大帐篷顶上的开口打开，千年彗星出现在开口的中央，巴特勒站在舞台的中央，他已经知道基拉祈的清醒了。他宣布“伟大的表演，开始”，舞台上升起四个装置，一根天线升起，对准了千年彗星。这时的黛安似乎感到一丝不安，巴特勒也是有着不小的野望，总有人选择追求一些不切实际的东西；而明龖也有点高兴，也许自己有机会回到原来的世界，但宝可梦世界的东西又真的那么容易舍弃吗，明龖还没有真正的认真考虑过。