明龖一行人在蘑蘑菇森林就餐的时候，小智的龙虾小兵因为和小遥的火稚鸡抢食物而打了起来；两只宝可梦打架也连累了一行人，最后好不容易被森林蜥蜴制止了。小智的这只龙虾小兵是无可争议的熊孩子，犯了错误还不愿意承认的那种，性子又倔，撞了南墙都不会回头的。另一方面，饥肠辘辘的火箭队在森林中看见了运送水果的蘑蘑菇，他们抢了蘑蘑菇的水果吃了起来；愤怒的蘑蘑菇们进化成为斗笠菇，开始追打火箭队。逃跑的火箭队遇上了小智一行人，结果害的小智一行人也一起被斗笠菇打飞了。
斗笠菇体型如同袋鼠（也叫蘑菇袋鼠），是草属性和格斗属性的蘑菇宝可梦，以绿色和米黄色为主，手腕处富有弹性，可以轻松地攻击对手，四肢上有两个红色的爪指；头上的“蘑菇”形成了斗笠状，斗笠上有两个红色的球形物体，对称地长两边，中间有气孔，尾巴尖端有四个绿色球形物体环绕。它会以草原或森林里的草木为食，斗笠菇的双爪可以从脖子底下自如的伸出，并用双爪发出音速拳等攻击；尾巴上的种子会放出毒孢子，然后再让因吸入孢子而苦痛不堪的对手吃上一记重拳，一类很有特点的神奇宝贝。
大伙因此走散了，开始在森林里寻找同伴，同时还要躲避斗笠菇的“报复”；过程混乱不堪，还好最后大家聚焦到了一起，也包括了火箭队，但大家也一起闯入了蘑蘑菇和斗笠菇的“老巢”。一场大战在所难免，龙虾小兵这个死小孩，今天早上犯了错误死不承认，反过来为了保护火稚鸡也是寸步不让；这也把有点胆小怕事的火稚鸡感动到了，小遥的火稚鸡进化成了力壮鸡，它和斗笠菇首领的对决将决定这件事情的最终走向。
力壮鸡的身体主要由浅黄色和橙色构成，它有着十分锋利的爪子；通常居住在草地中，会在山野上跑来跑去锻炼腰腿（其实野生的力壮鸡非常少见）。进化之后增加了格斗属性，有着１秒内连踢１０次的腿技，会用尖锐的叫声威吓对手；也会发出尖锐的叫声来集中注意力，踢技具有强大的破坏力，在对方放弃之前会持续奋战，是拥有强烈战斗本能的“幼鸡”宝可梦。它的鸟嘴里依旧可以吐出的灼热火焰，虽然还是“幼鸡”，但它们的天生战斗本能已经得以释放，早已不是那个蠢萌蠢萌的小火鸡了。
刚刚进化的力壮鸡，已经学会了火焰旋涡和冲天拳；斗笠菇头领这边也是战意满满，作为格斗系宝可梦邀请力壮鸡进行格斗对决。小遥的力壮鸡同样没有理由拒绝，凭借更强的战斗意志也就勉强和斗笠菇头领打平，今天的事情也算告一段落；但“罪魁祸首”火箭队三人组可不会被简单放过，他们不得不接受力壮鸡和斗笠菇的双重大礼。
斗笠菇属性方面喜忧参半，而种族三围非常平庸，一般都是物攻手的定位，草属性和格斗属性的招式都还是可以的；顶级物攻很不错，但速度偏慢就有点不够看，整体种族天赋实在非常普通。那是什么让它的出场率一直不低，是它的特性，而且是两个特性都可以做不少的文章；作为蘑菇受到攻击时，有时会把接触到自己的对手变为中毒、麻痹或睡眠状态的孢子这个只是常规普通款，真正让它“名扬四海”的是毒疗和技术高手。
毒疗是指如果宝可梦受到中毒和剧毒的伤害，此特性将在每回合中恢复血量；技术高手则是使用威力较小的招式是，威力提升原来的一半，两个看上去都很简单，但使用得当都很惊人。曾经的毒疗菇非常风靡，靠着一手蘑菇孢子携带剧毒珠替身打消耗是很多玩家曾经的噩梦，但是随着环境变化以及妖精系崛起，毒疗菇已经越来越站不住脚，于是现在基本环境下很多玩家选择的都是技师蘑菇，不过毒疗没了不代表技师就不好用，依靠技师的加成，斗笠菇依然可以做出不错的输出，因此泛用性依然非常可观。
孢子特性不行，但斗笠菇的招式蘑菇孢子是它们安身立命之本，这招会使目标陷入睡眠状态，号称S级技能；以上种种，造就了斗笠菇在种族天赋平庸至极的情况下依旧很受欢迎的情况，没有不行的宝可梦只有不会用的训练家这句话又要勉强用用了。
明龖的好多观点还是停留在前世的宝可梦对决，宝可梦世界可比数据要复杂的多了，但还是有一些共通之处，这个世界把对决数据化的流派也是存在的，没有绝对对错，但很多时候一旦上升到了荣誉层面，就会不可避免的“唯胜利论”。
继续上路的小智一行人突然遇到了奇怪的天气，先是晴空万里接着瓢泼大雨马上又变成了鹅毛大雪；这时，他们看见了一只奇怪的宝可梦—飘浮泡泡，这里怪异的天气是附近的天气研究所造成的，研究所的所长前来邀请小智一行人来研究所参观。
巴鲁就是天气研究所的所长，发现明龖一行人被变化多端的天气困扰着，巴鲁和他的助手咪莉出现跟他们道歉，因为这是他们研究所的研究所造成的。自我介绍之后，巴鲁邀请小智等人前往研究所稍作休息；抵达研究所后，巴鲁让咪莉带着小智等人去里面，并对其他研究员夸赞咪莉虽然才来不久但是已经很能干了，并且肯定了其他研究员认为咪莉会成为一优秀研究员的想法，明龖应该已经感受到了一些异常，但还是选择不影响它。
接在，海洋队就登场袭击了研究所，巴鲁问他们是什么人却被他们控制了起来，泉美还派出铁螯龙虾看着巴鲁和其它研究所的研究员。当海洋队使用天气控制机测试时，巴鲁让其他研究员快趴下避免了危险，接着巴鲁得知了海洋队是为了研究所的超古代宝可梦资料而来，泉美想要抢夺解开电脑用的巴鲁的通行卡，巴鲁让飘浮泡泡将通行卡交给咪莉，并且指挥飘浮泡泡躲开铁螯龙虾的追击进入的所内的换气口。
在研究所里，从换气口出来的飘浮泡泡立刻遭到了海洋队手下的包夹，但是小智等人和咪莉就在旁边，飘浮泡泡将通行卡交到了咪莉的手里。接着为了将电脑室外的手下引开，咪莉的百变怪变成飘浮泡泡引走它们；咪莉顺利拷贝了电脑里超古代宝可梦资料并把这些从电脑里删除，小智他们都没有意识到他的真正意图。
接着，巴鲁被泉美当做人质来交换小智等人手中的通行卡，巴鲁以为他们是虚张声势但没想到泉美却动了真格，不过巴鲁还是坚持让咪莉不要交出通行卡。咪莉“被迫”交出通行卡后，巴鲁对咪莉的做法有点矛盾；同时趁机小智等人也把巴鲁救了出来，而后巴鲁对露出真面目的咪莉真身班纳伊感到惊诧，巴鲁对咪莉的事情感到很沮丧。这时真正的咪莉出现了，巴鲁派她将超古代宝可梦的资料存储起来（纸质的），并表示自己也会帮忙的。
飘浮泡泡是巴鲁的宝可梦，飘浮泡泡跟旅程中的小智等人相遇，它随着天气研究所的天气控制机改变了形态这使得小智等人觉得很神奇。在这之后，海洋队袭击了研究所，巴鲁指挥飘浮泡泡使用气象球攻击铁螯龙虾，但却被另一只铁螯龙虾攻击中，这时天气变成晴天飘浮泡泡的样子也改变了，但是不论是火属性还是水属性都对铁螯龙虾没有什么效果。
班纳伊是熔岩队的一名手下，由于有着高超的变装能力，被人称作千面人。他伪装成咪莉的相貌来取得天气研究所成员的信任，当海洋队威逼研究所成员交出超古代的宝可梦资料时，他和小智一行人成功复制了数据资料，并最终顺利逃跑。百变怪是班纳伊的搭档，常跟在班纳伊身旁，这类擅长伪装的高手和百变怪还是异常般配的。
飘浮泡泡主色为灰色，还拥有有太阳、雨水、雪云三种样子，每种形态都会改变漂浮泡泡的外貌以及属性，太阳的样子头部形状像是太阳，雨天形状的头部样子则是水滴，雪云样子则像是头部被云朵包裹住。天气变化的话，脾气也会跟着变化；飘浮泡泡有依据天气转换形态的能力，大晴天时为火属性，下雨时为水属性，下雪或下冰雹时会为冰属性，没有明显天气变化，或者其他天气时则会保持飘浮泡泡的样子，为一般属性。
距离固拉多和盖欧卡的出现已经越来越近了，天气元素的不断挖掘，很多体系还在完善，明龖的“雨天队”也差不多可以登堂入室了；明龖应该无力阻止历史的重演，但考虑到有各种各样的“光环之子”，想来也不会对宝可梦世界造成特别大的伤害，且静观其变吧。